Protein–RNA interactions for Protein: Q6A162

KRT40, Keratin, type I cytoskeletal 40, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT40Q6A162 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT40Q6A162 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT40Q6A162 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT40Q6A162 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT40Q6A162 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT40Q6A162 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT40Q6A162 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT40Q6A162 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT40Q6A162 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT40Q6A162 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT40Q6A162 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT40Q6A162 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT40Q6A162 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT40Q6A162 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT40Q6A162 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT40Q6A162 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT40Q6A162 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT40Q6A162 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT40Q6A162 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT40Q6A162 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT40Q6A162 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT40Q6A162 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT40Q6A162 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT40Q6A162 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT40Q6A162 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT40Q6A162 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT40Q6A162 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT40Q6A162 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT40Q6A162 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KRT40Q6A162 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT40Q6A162 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT40Q6A162 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT40Q6A162 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT40Q6A162 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT40Q6A162 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT40Q6A162 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT40Q6A162 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT40Q6A162 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT40Q6A162 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT40Q6A162 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT40Q6A162 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT40Q6A162 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT40Q6A162 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT40Q6A162 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT40Q6A162 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT40Q6A162 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT40Q6A162 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT40Q6A162 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT40Q6A162 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT40Q6A162 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT40Q6A162 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT40Q6A162 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT40Q6A162 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT40Q6A162 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT40Q6A162 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT40Q6A162 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT40Q6A162 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT40Q6A162 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT40Q6A162 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT40Q6A162 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT40Q6A162 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT40Q6A162 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT40Q6A162 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms