Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WSCD1Q658N2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
WSCD1Q658N2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WSCD1Q658N2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms