Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ALS2CLQ60I27 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ALS2CLQ60I27 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ALS2CLQ60I27 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms