Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLX4IPQ5VYV7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLX4IPQ5VYV7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLX4IPQ5VYV7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms