Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CHIC1Q5VXU3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CHIC1Q5VXU3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CHIC1Q5VXU3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CHIC1Q5VXU3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CHIC1Q5VXU3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CHIC1Q5VXU3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CHIC1Q5VXU3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
CHIC1Q5VXU3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
CHIC1Q5VXU3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
CHIC1Q5VXU3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
CHIC1Q5VXU3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
CHIC1Q5VXU3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
CHIC1Q5VXU3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
CHIC1Q5VXU3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
CHIC1Q5VXU3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
CHIC1Q5VXU3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CHIC1Q5VXU3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
CHIC1Q5VXU3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
CHIC1Q5VXU3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
CHIC1Q5VXU3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
CHIC1Q5VXU3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
CHIC1Q5VXU3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
CHIC1Q5VXU3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
CHIC1Q5VXU3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
CHIC1Q5VXU3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
CHIC1Q5VXU3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
CHIC1Q5VXU3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CHIC1Q5VXU3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
CHIC1Q5VXU3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CHIC1Q5VXU3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CHIC1Q5VXU3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
CHIC1Q5VXU3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
CHIC1Q5VXU3 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
CHIC1Q5VXU3 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
CHIC1Q5VXU3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
CHIC1Q5VXU3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
CHIC1Q5VXU3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
CHIC1Q5VXU3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
CHIC1Q5VXU3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
CHIC1Q5VXU3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
CHIC1Q5VXU3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
CHIC1Q5VXU3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
CHIC1Q5VXU3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
CHIC1Q5VXU3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
CHIC1Q5VXU3 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
CHIC1Q5VXU3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
CHIC1Q5VXU3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
CHIC1Q5VXU3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
CHIC1Q5VXU3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
CHIC1Q5VXU3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
CHIC1Q5VXU3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
CHIC1Q5VXU3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
CHIC1Q5VXU3 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
CHIC1Q5VXU3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CHIC1Q5VXU3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
CHIC1Q5VXU3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
CHIC1Q5VXU3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC40.59■■■■■ 4.09
CHIC1Q5VXU3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
CHIC1Q5VXU3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
CHIC1Q5VXU3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CHIC1Q5VXU3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
CHIC1Q5VXU3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
CHIC1Q5VXU3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
CHIC1Q5VXU3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.09
CHIC1Q5VXU3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
CHIC1Q5VXU3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
CHIC1Q5VXU3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CHIC1Q5VXU3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CHIC1Q5VXU3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CHIC1Q5VXU3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CHIC1Q5VXU3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CHIC1Q5VXU3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CHIC1Q5VXU3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CHIC1Q5VXU3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CHIC1Q5VXU3 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
CHIC1Q5VXU3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CHIC1Q5VXU3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
CHIC1Q5VXU3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
CHIC1Q5VXU3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
CHIC1Q5VXU3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
CHIC1Q5VXU3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
CHIC1Q5VXU3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
CHIC1Q5VXU3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
CHIC1Q5VXU3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
CHIC1Q5VXU3 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
CHIC1Q5VXU3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
CHIC1Q5VXU3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
CHIC1Q5VXU3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CHIC1Q5VXU3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CHIC1Q5VXU3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CHIC1Q5VXU3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
CHIC1Q5VXU3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
CHIC1Q5VXU3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
CHIC1Q5VXU3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
CHIC1Q5VXU3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CHIC1Q5VXU3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CHIC1Q5VXU3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
CHIC1Q5VXU3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
CHIC1Q5VXU3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms