Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
OTUD1Q5VV17 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTUD1Q5VV17 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
OTUD1Q5VV17 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
OTUD1Q5VV17 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
OTUD1Q5VV17 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTUD1Q5VV17 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTUD1Q5VV17 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTUD1Q5VV17 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTUD1Q5VV17 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
OTUD1Q5VV17 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
OTUD1Q5VV17 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
OTUD1Q5VV17 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
OTUD1Q5VV17 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUD1Q5VV17 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms