Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC7Q5VTL7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
FNDC7Q5VTL7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FNDC7Q5VTL7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FNDC7Q5VTL7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FNDC7Q5VTL7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms