Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EEF1A1P5Q5VTE0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EEF1A1P5Q5VTE0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EEF1A1P5Q5VTE0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EEF1A1P5Q5VTE0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms