Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CELF3Q5SZQ8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CELF3Q5SZQ8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CELF3Q5SZQ8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CELF3Q5SZQ8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CELF3Q5SZQ8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CELF3Q5SZQ8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CELF3Q5SZQ8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CELF3Q5SZQ8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CELF3Q5SZQ8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CELF3Q5SZQ8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CELF3Q5SZQ8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CELF3Q5SZQ8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CELF3Q5SZQ8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CELF3Q5SZQ8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CELF3Q5SZQ8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CELF3Q5SZQ8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CELF3Q5SZQ8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CELF3Q5SZQ8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CELF3Q5SZQ8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CELF3Q5SZQ8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CELF3Q5SZQ8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CELF3Q5SZQ8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CELF3Q5SZQ8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CELF3Q5SZQ8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms