Protein–RNA interactions for Protein: Q5MAI5

CDKL4, Cyclin-dependent kinase-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL4Q5MAI5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL4Q5MAI5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDKL4Q5MAI5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDKL4Q5MAI5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms