Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KCNT1Q5JUK3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNT1Q5JUK3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNT1Q5JUK3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms