Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTH9

RRP12, RRP12-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP12Q5JTH9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP12Q5JTH9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP12Q5JTH9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP12Q5JTH9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP12Q5JTH9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RRP12Q5JTH9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP12Q5JTH9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP12Q5JTH9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP12Q5JTH9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP12Q5JTH9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP12Q5JTH9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP12Q5JTH9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP12Q5JTH9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP12Q5JTH9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP12Q5JTH9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP12Q5JTH9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RRP12Q5JTH9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP12Q5JTH9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP12Q5JTH9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP12Q5JTH9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP12Q5JTH9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP12Q5JTH9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP12Q5JTH9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RRP12Q5JTH9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP12Q5JTH9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP12Q5JTH9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RRP12Q5JTH9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP12Q5JTH9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP12Q5JTH9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP12Q5JTH9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP12Q5JTH9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RRP12Q5JTH9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP12Q5JTH9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP12Q5JTH9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP12Q5JTH9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP12Q5JTH9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP12Q5JTH9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RRP12Q5JTH9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP12Q5JTH9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP12Q5JTH9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP12Q5JTH9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RRP12Q5JTH9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP12Q5JTH9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RRP12Q5JTH9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RRP12Q5JTH9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RRP12Q5JTH9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RRP12Q5JTH9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP12Q5JTH9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RRP12Q5JTH9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP12Q5JTH9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP12Q5JTH9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP12Q5JTH9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP12Q5JTH9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP12Q5JTH9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RRP12Q5JTH9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP12Q5JTH9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP12Q5JTH9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP12Q5JTH9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP12Q5JTH9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP12Q5JTH9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RRP12Q5JTH9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP12Q5JTH9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP12Q5JTH9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP12Q5JTH9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP12Q5JTH9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP12Q5JTH9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP12Q5JTH9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP12Q5JTH9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RRP12Q5JTH9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms