Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8M3

EMC4, ER membrane protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC4Q5J8M3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EMC4Q5J8M3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EMC4Q5J8M3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EMC4Q5J8M3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EMC4Q5J8M3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EMC4Q5J8M3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms