Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CMPK2Q5EBM0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMPK2Q5EBM0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMPK2Q5EBM0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms