Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SBK1Q52WX2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SBK1Q52WX2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SBK1Q52WX2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SBK1Q52WX2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SBK1Q52WX2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SBK1Q52WX2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SBK1Q52WX2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SBK1Q52WX2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SBK1Q52WX2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SBK1Q52WX2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SBK1Q52WX2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SBK1Q52WX2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SBK1Q52WX2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SBK1Q52WX2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SBK1Q52WX2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SBK1Q52WX2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SBK1Q52WX2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SBK1Q52WX2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms