Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJI4

SLC9B1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9B1Q4ZJI4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC9B1Q4ZJI4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC9B1Q4ZJI4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9B1Q4ZJI4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms