Protein–RNA interactions for Protein: Q496J9

SV2C, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2CQ496J9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SV2CQ496J9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SV2CQ496J9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SV2CQ496J9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SV2CQ496J9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SV2CQ496J9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SV2CQ496J9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SV2CQ496J9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SV2CQ496J9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SV2CQ496J9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SV2CQ496J9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SV2CQ496J9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SV2CQ496J9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SV2CQ496J9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SV2CQ496J9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SV2CQ496J9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SV2CQ496J9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SV2CQ496J9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SV2CQ496J9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SV2CQ496J9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SV2CQ496J9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SV2CQ496J9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SV2CQ496J9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SV2CQ496J9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SV2CQ496J9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SV2CQ496J9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SV2CQ496J9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SV2CQ496J9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SV2CQ496J9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SV2CQ496J9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SV2CQ496J9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SV2CQ496J9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SV2CQ496J9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SV2CQ496J9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SV2CQ496J9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SV2CQ496J9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SV2CQ496J9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SV2CQ496J9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SV2CQ496J9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SV2CQ496J9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SV2CQ496J9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SV2CQ496J9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SV2CQ496J9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SV2CQ496J9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2CQ496J9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2CQ496J9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2CQ496J9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SV2CQ496J9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms