Protein–RNA interactions for Protein: Q494U1

PLEKHN1, Pleckstrin homology domain-containing family N member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHN1Q494U1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLEKHN1Q494U1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLEKHN1Q494U1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLEKHN1Q494U1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLEKHN1Q494U1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLEKHN1Q494U1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLEKHN1Q494U1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLEKHN1Q494U1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PLEKHN1Q494U1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLEKHN1Q494U1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLEKHN1Q494U1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLEKHN1Q494U1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLEKHN1Q494U1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLEKHN1Q494U1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLEKHN1Q494U1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PLEKHN1Q494U1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLEKHN1Q494U1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PLEKHN1Q494U1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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