Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF260Q3ZCT1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNF260Q3ZCT1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF260Q3ZCT1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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