Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIR4

TMEM30B, Cell cycle control protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30BQ3MIR4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM30BQ3MIR4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TMEM30BQ3MIR4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms