Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-BQ31612 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HLA-BQ31612 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HLA-BQ31612 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HLA-BQ31612 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms