Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
VWC2Q2TAL6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VWC2Q2TAL6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VWC2Q2TAL6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VWC2Q2TAL6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VWC2Q2TAL6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VWC2Q2TAL6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VWC2Q2TAL6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VWC2Q2TAL6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VWC2Q2TAL6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VWC2Q2TAL6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VWC2Q2TAL6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VWC2Q2TAL6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VWC2Q2TAL6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VWC2Q2TAL6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VWC2Q2TAL6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VWC2Q2TAL6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VWC2Q2TAL6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VWC2Q2TAL6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VWC2Q2TAL6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VWC2Q2TAL6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VWC2Q2TAL6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VWC2Q2TAL6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VWC2Q2TAL6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms