Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSPP1Q1MSJ5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSPP1Q1MSJ5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSPP1Q1MSJ5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSPP1Q1MSJ5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSPP1Q1MSJ5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CSPP1Q1MSJ5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CSPP1Q1MSJ5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSPP1Q1MSJ5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CSPP1Q1MSJ5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSPP1Q1MSJ5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CSPP1Q1MSJ5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CSPP1Q1MSJ5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSPP1Q1MSJ5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSPP1Q1MSJ5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSPP1Q1MSJ5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSPP1Q1MSJ5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSPP1Q1MSJ5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CSPP1Q1MSJ5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CSPP1Q1MSJ5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CSPP1Q1MSJ5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CSPP1Q1MSJ5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CSPP1Q1MSJ5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms