Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IMPG1Q17R60 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IMPG1Q17R60 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IMPG1Q17R60 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IMPG1Q17R60 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
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