Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRNQ16849 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTPRNQ16849 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRNQ16849 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRNQ16849 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRNQ16849 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRNQ16849 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRNQ16849 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRNQ16849 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRNQ16849 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRNQ16849 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRNQ16849 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRNQ16849 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRNQ16849 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRNQ16849 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRNQ16849 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRNQ16849 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRNQ16849 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRNQ16849 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRNQ16849 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRNQ16849 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRNQ16849 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRNQ16849 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRNQ16849 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRNQ16849 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRNQ16849 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRNQ16849 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRNQ16849 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRNQ16849 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRNQ16849 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRNQ16849 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRNQ16849 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRNQ16849 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRNQ16849 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
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