Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPP1R3AQ16821 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP1R3AQ16821 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R3AQ16821 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
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