Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA6Q15825 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHRNA6Q15825 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRNA6Q15825 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
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