Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMAD1Q15797 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMAD1Q15797 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMAD1Q15797 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
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