Protein–RNA interactions for Protein: Q15596

NCOA2, Nuclear receptor coactivator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA2Q15596 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NCOA2Q15596 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NCOA2Q15596 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NCOA2Q15596 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NCOA2Q15596 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NCOA2Q15596 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NCOA2Q15596 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NCOA2Q15596 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NCOA2Q15596 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NCOA2Q15596 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NCOA2Q15596 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NCOA2Q15596 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
NCOA2Q15596 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NCOA2Q15596 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
NCOA2Q15596 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
NCOA2Q15596 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NCOA2Q15596 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
NCOA2Q15596 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NCOA2Q15596 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NCOA2Q15596 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NCOA2Q15596 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
NCOA2Q15596 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
NCOA2Q15596 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NCOA2Q15596 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NCOA2Q15596 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NCOA2Q15596 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NCOA2Q15596 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
NCOA2Q15596 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
NCOA2Q15596 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
NCOA2Q15596 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
NCOA2Q15596 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NCOA2Q15596 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NCOA2Q15596 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NCOA2Q15596 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NCOA2Q15596 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NCOA2Q15596 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NCOA2Q15596 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NCOA2Q15596 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NCOA2Q15596 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NCOA2Q15596 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NCOA2Q15596 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
NCOA2Q15596 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NCOA2Q15596 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NCOA2Q15596 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NCOA2Q15596 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NCOA2Q15596 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NCOA2Q15596 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
NCOA2Q15596 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NCOA2Q15596 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
NCOA2Q15596 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
NCOA2Q15596 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NCOA2Q15596 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NCOA2Q15596 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
NCOA2Q15596 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NCOA2Q15596 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NCOA2Q15596 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NCOA2Q15596 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NCOA2Q15596 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NCOA2Q15596 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NCOA2Q15596 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NCOA2Q15596 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NCOA2Q15596 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NCOA2Q15596 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NCOA2Q15596 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NCOA2Q15596 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NCOA2Q15596 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
NCOA2Q15596 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NCOA2Q15596 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
NCOA2Q15596 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NCOA2Q15596 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
NCOA2Q15596 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
NCOA2Q15596 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NCOA2Q15596 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NCOA2Q15596 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
NCOA2Q15596 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NCOA2Q15596 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
NCOA2Q15596 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NCOA2Q15596 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
NCOA2Q15596 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
NCOA2Q15596 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
NCOA2Q15596 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
NCOA2Q15596 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
NCOA2Q15596 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NCOA2Q15596 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NCOA2Q15596 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
NCOA2Q15596 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NCOA2Q15596 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NCOA2Q15596 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NCOA2Q15596 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NCOA2Q15596 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NCOA2Q15596 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NCOA2Q15596 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
NCOA2Q15596 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NCOA2Q15596 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
NCOA2Q15596 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NCOA2Q15596 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NCOA2Q15596 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NCOA2Q15596 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NCOA2Q15596 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
NCOA2Q15596 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms