Protein–RNA interactions for Protein: Q15418

RPS6KA1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA1Q15418 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPS6KA1Q15418 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPS6KA1Q15418 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPS6KA1Q15418 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPS6KA1Q15418 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.9 ms