Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLR1Q15399 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TLR1Q15399 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLR1Q15399 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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