Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Length 2,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCM1Q15154 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCM1Q15154 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCM1Q15154 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PCM1Q15154 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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