Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX17Q15036 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX17Q15036 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX17Q15036 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX17Q15036 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX17Q15036 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX17Q15036 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX17Q15036 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX17Q15036 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX17Q15036 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX17Q15036 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX17Q15036 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX17Q15036 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX17Q15036 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX17Q15036 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX17Q15036 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX17Q15036 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX17Q15036 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX17Q15036 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX17Q15036 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX17Q15036 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX17Q15036 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX17Q15036 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX17Q15036 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX17Q15036 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX17Q15036 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX17Q15036 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX17Q15036 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SNX17Q15036 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX17Q15036 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
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