Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHD4Q14839 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHD4Q14839 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHD4Q14839 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHD4Q14839 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
CHD4Q14839 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHD4Q14839 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CHD4Q14839 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CHD4Q14839 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.44
CHD4Q14839 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
CHD4Q14839 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHD4Q14839 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHD4Q14839 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHD4Q14839 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHD4Q14839 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHD4Q14839 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CHD4Q14839 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CHD4Q14839 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CHD4Q14839 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CHD4Q14839 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CHD4Q14839 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CHD4Q14839 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CHD4Q14839 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CHD4Q14839 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CHD4Q14839 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CHD4Q14839 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CHD4Q14839 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHD4Q14839 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHD4Q14839 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
CHD4Q14839 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHD4Q14839 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CHD4Q14839 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHD4Q14839 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHD4Q14839 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHD4Q14839 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHD4Q14839 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHD4Q14839 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CHD4Q14839 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CHD4Q14839 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CHD4Q14839 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CHD4Q14839 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CHD4Q14839 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CHD4Q14839 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
CHD4Q14839 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CHD4Q14839 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CHD4Q14839 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHD4Q14839 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CHD4Q14839 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CHD4Q14839 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
CHD4Q14839 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHD4Q14839 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHD4Q14839 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHD4Q14839 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHD4Q14839 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CHD4Q14839 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CHD4Q14839 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CHD4Q14839 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CHD4Q14839 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHD4Q14839 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHD4Q14839 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHD4Q14839 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHD4Q14839 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHD4Q14839 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CHD4Q14839 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHD4Q14839 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CHD4Q14839 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CHD4Q14839 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
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