Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SMC1AQ14683 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SMC1AQ14683 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMC1AQ14683 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMC1AQ14683 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
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