Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VGLL4Q14135 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VGLL4Q14135 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
VGLL4Q14135 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VGLL4Q14135 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms