Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CIRBPQ14011 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CIRBPQ14011 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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