Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPSQ13938 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPSQ13938 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPSQ13938 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
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