Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2H2Q13888 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2H2Q13888 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
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