Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EXOSC2Q13868 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EXOSC2Q13868 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EXOSC2Q13868 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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