Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CUL4BQ13620 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CUL4BQ13620 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CUL4BQ13620 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CUL4BQ13620 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
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