Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
HDAC1Q13547 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
HDAC1Q13547 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HDAC1Q13547 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
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