Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TCIRG1Q13488 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TCIRG1Q13488 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TCIRG1Q13488 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TCIRG1Q13488 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TCIRG1Q13488 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TCIRG1Q13488 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TCIRG1Q13488 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TCIRG1Q13488 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TCIRG1Q13488 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TCIRG1Q13488 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TCIRG1Q13488 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TCIRG1Q13488 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TCIRG1Q13488 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TCIRG1Q13488 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TCIRG1Q13488 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TCIRG1Q13488 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TCIRG1Q13488 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TCIRG1Q13488 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TCIRG1Q13488 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TCIRG1Q13488 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TCIRG1Q13488 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TCIRG1Q13488 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
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