Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMED1Q13445 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMED1Q13445 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMED1Q13445 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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