Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AP3B2Q13367 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
AP3B2Q13367 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AP3B2Q13367 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AP3B2Q13367 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
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