Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLF1Q13351 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLF1Q13351 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLF1Q13351 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLF1Q13351 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLF1Q13351 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLF1Q13351 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLF1Q13351 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLF1Q13351 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLF1Q13351 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLF1Q13351 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLF1Q13351 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLF1Q13351 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLF1Q13351 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLF1Q13351 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLF1Q13351 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLF1Q13351 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KLF1Q13351 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KLF1Q13351 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLF1Q13351 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLF1Q13351 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLF1Q13351 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLF1Q13351 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLF1Q13351 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLF1Q13351 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLF1Q13351 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLF1Q13351 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLF1Q13351 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLF1Q13351 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLF1Q13351 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
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