Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTGDRQ13258 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTGDRQ13258 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTGDRQ13258 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTGDRQ13258 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTGDRQ13258 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTGDRQ13258 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTGDRQ13258 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTGDRQ13258 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTGDRQ13258 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTGDRQ13258 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTGDRQ13258 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTGDRQ13258 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTGDRQ13258 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTGDRQ13258 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PTGDRQ13258 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PTGDRQ13258 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PTGDRQ13258 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTGDRQ13258 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTGDRQ13258 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTGDRQ13258 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTGDRQ13258 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PTGDRQ13258 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PTGDRQ13258 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PTGDRQ13258 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTGDRQ13258 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTGDRQ13258 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTGDRQ13258 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTGDRQ13258 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTGDRQ13258 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PTGDRQ13258 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PTGDRQ13258 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PTGDRQ13258 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTGDRQ13258 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTGDRQ13258 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTGDRQ13258 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PTGDRQ13258 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTGDRQ13258 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PTGDRQ13258 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PTGDRQ13258 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PTGDRQ13258 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PTGDRQ13258 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTGDRQ13258 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTGDRQ13258 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTGDRQ13258 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTGDRQ13258 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTGDRQ13258 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTGDRQ13258 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTGDRQ13258 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTGDRQ13258 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTGDRQ13258 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PTGDRQ13258 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PTGDRQ13258 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
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