Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRSF5Q13243 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRSF5Q13243 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SRSF5Q13243 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRSF5Q13243 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
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