Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NME3Q13232 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME3Q13232 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME3Q13232 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME3Q13232 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NME3Q13232 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME3Q13232 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME3Q13232 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NME3Q13232 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME3Q13232 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME3Q13232 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NME3Q13232 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME3Q13232 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME3Q13232 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NME3Q13232 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME3Q13232 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME3Q13232 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME3Q13232 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME3Q13232 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME3Q13232 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME3Q13232 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NME3Q13232 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME3Q13232 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME3Q13232 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME3Q13232 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME3Q13232 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME3Q13232 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME3Q13232 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NME3Q13232 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME3Q13232 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME3Q13232 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME3Q13232 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME3Q13232 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME3Q13232 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME3Q13232 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME3Q13232 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME3Q13232 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NME3Q13232 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NME3Q13232 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NME3Q13232 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NME3Q13232 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NME3Q13232 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NME3Q13232 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NME3Q13232 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME3Q13232 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME3Q13232 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME3Q13232 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME3Q13232 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME3Q13232 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME3Q13232 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NME3Q13232 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME3Q13232 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NME3Q13232 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME3Q13232 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME3Q13232 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME3Q13232 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NME3Q13232 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NME3Q13232 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME3Q13232 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME3Q13232 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME3Q13232 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NME3Q13232 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME3Q13232 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NME3Q13232 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME3Q13232 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME3Q13232 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME3Q13232 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME3Q13232 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME3Q13232 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME3Q13232 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME3Q13232 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NME3Q13232 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NME3Q13232 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NME3Q13232 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NME3Q13232 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NME3Q13232 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NME3Q13232 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NME3Q13232 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME3Q13232 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME3Q13232 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME3Q13232 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME3Q13232 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME3Q13232 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NME3Q13232 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME3Q13232 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME3Q13232 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME3Q13232 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NME3Q13232 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NME3Q13232 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME3Q13232 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NME3Q13232 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NME3Q13232 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME3Q13232 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME3Q13232 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME3Q13232 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME3Q13232 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME3Q13232 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME3Q13232 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME3Q13232 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NME3Q13232 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
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