Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ECH1Q13011 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ECH1Q13011 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ECH1Q13011 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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